划分两个主分区
用分区魔术师在硬盘上进行分区操作。要求创建两个主分区，其它的逻辑分区任意。如果要构建包含Windows 98的独立多系统，请将主分区之一设为FAT32格式，第一个逻辑分区也设为FAT32格式。
为方便后面的叙述，我们暂时设第一主分区、第二主分区、第一个逻辑分区的卷标分别是P1、P2、L1。如图1所示。
安装独立多系统
用分区魔术师将主分区之一设置为活动分区，默认另一主分区将自动处于隐藏状态。在活动的主分区之上安装一套操作系统。
同理，将另一主分区设置为活动分区，默认已安装了操作系统的那个主分区自动隐藏，安装另一套操作系统。
不管在哪一活动分区下安装操作系统，方法都与常规方法相同。但由于安装一套系统时，另一系统所在的主分区已处于隐藏状态，所以两系统是完全独立的，而且只能启动处于活动状态的主分区所安装的系统。
为方便后面的叙述，我们将安装到第一、二主分区下的系统分别称为第一套系统、第二套系统。
分离切换工具
在任一系统下安装完全版的分区魔术师，在其安装目录找出以下文件：PQBOOT.EXE、PQBOOTX.EXE、PQVXD.vxd、Pqboot32.exe、pqbw.exe、pqbw.rtc、pqpe.rtc。
分区魔术师的默认安装目录是“C:Program FilesPowerQuestPartitionMagic 8.0”，请将以上文件拷贝到第一逻辑分区的任一新建目录下备用。为方便叙述，设新建的目录名为“PQBOOT”。
快速切换多系统
默认设置下，启动到任何一套系统下时，另一系统所在的主分区处于隐藏状态，为此，不管启动到哪一系统下，该系统所在分区的盘符将自动被标识为C盘，第一逻辑分区被标识为D盘。在后面的操作中，我们还要将两个主分区都显示出来，但不管怎样，都只能启动到处于活动状态的主分区所在的系统下，它的盘符是C，另一系统所在的主分区的盘符将自动标识到硬盘分区的最后，也就是说，两主分区之一为C盘，第一逻辑分区永远将是D盘。
假设分区规划如图1所示，如果两主分区都没隐藏，第一、二主分区下安装的分别是Windows XP、Windows 98，那么，启动到windows 98下时，第二主分区、第一逻辑分区的盘符将分别是C、D（注Windows 98不能识别NTFS分区）；启动到Windows XP下时，第一主分区、第一逻辑分区、第二逻辑分区的盘符将分别是C、D、E，第二主分区的盘符是F。
不管启动到哪一系统下，我们都可到 “D: PQBOOT”目录下去运行“pqbw.exe”，得到图2所示的界面。
在这一界面中，我们能清楚地看到两主分区的卷标，每一主分区的当前状态：即“Status”字段下的值，“Active”表示该分区处于活动状态，当前工作的系统就在该分区下。选中另一分区，并选中“Restart”，再单击“OK”，当前系统就会马上关闭且PC重启到另一系统下。另外，运行我们已拷贝到“D: PQBOOT”下的PQboot32和PQboot，也能实现以上功能，只不过PQboot32运行于Windows的命令提示符窗口，PQboot只能运行于纯DOS之下。这两个命令都能带参数运行，这就为我们用批处理来实现“一键转换”提供了可能。下面以在第一系统下转换第二套系统为例进行说明：
在第一套系统下建立一个批处理，其中只包含一个命令行：
D:PQboot32 /V: P2
再在桌面上为这个批处理创建一个快捷方式或指定一个快捷键，今后，只要运行该批处理，系统就会自动转换到第二套系统下。
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